Een ambitieus, door de EG gefinancierd onderzoeksinitiatief over epigenetica op weg naar systeembiologie

Wat is chromatine, euchromatine en heterochromatine?

Chromatine is de moleculaire substantie van een chromosoom. Het bestaat uit een complex van DNA, RNA en eiwit in eukaryote cellen. Vaak komen mensen plaatjes van chromosomen tegen met een gestreept patroon van sterkere en lichtere kleuring. Wat zijn deze chromosoombanden? Vertegenwoordigen ze genen? Nee, ze vertegenwoordigen niet noodzakelijk genen, noch komen ze automatisch overeen met stukken zonder genen. Chromosomen die vaak aan het publiek worden gepresenteerd, zijn de hoogst gecomprimeerde metafasechromosomen of de gigantische chromosomen (d.w.z. polytene chromosoom) van Drosophila-larven uit speekselkliercellen. Deze laatste zijn opgebouwd uit ongeveer 2000 dubbele DNA-strengen die parallel aan elkaar zijn gerangschikt. Een enkele band van een Drosophila-gigantisch chromosoom kan ongeveer 50.000 nucleotiden achter elkaar bevatten. Maar wat maakt zijn kleuring anders dan een aangrenzende band? Wat we zien als donkere banden is een gevolg van een verhoogde concentratie van DNA binnen variabel, compact chromatine dat gemiddeld elke 50 kb in kleuring verschilt. Maar er is ook een gradiënt van verschillende verdichtingsgraden van hogere orde. Verder verandert het in het leven van een chromosoom zijn uiterlijk. Tijdens de zogenaamde interfase is het ontspannen met veel open chromatine (zie FAQ 7). Tijdens deze fase behouden sommige volledige chromosomen, maar meestal slechts delen ervan, een sterke kleuring. Deze subnucleaire kenmerken zijn bekend sinds de vroege dagen van de cytologie. In 1928 introduceerde Heitz voor hen de term ‘heterochromatine’. Euchromatine, aan de andere kant, is sterk gedecondenseerd chromatine. Chromosomale gebieden in het genoom die een hoog aantal genen missen, worden normaal gesproken verdicht in heterochromatine, terwijl chromosomale gebieden met hoge concentraties van getranscribeerde genen deel uitmaken van ontspannen euchromatine. Maar deze patronen veranderen tijdens de ontwikkeling, afhankelijk van het patroon van bepaalde epigenetische tags die in het chromatine aanwezig zijn (zie FAQ 8).

LAAT EEN REACTIE ACHTER

Please enter your comment!
Please enter your name here